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产品介绍:
染色质免疫共沉淀(ChIP)试剂盒,包含足够完成 20个反应的试剂。
试剂盒组分:
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产品编号 |
产品名称 |
包装 |
保存温度 |
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DW1151-A |
Cell lysis buffer |
25ml |
4℃,一年 |
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DW1151-B |
Low salt wash buffer |
80ml |
4℃,一年 |
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DW1151-C |
High salt wash buffer |
25ml |
4℃,一年 |
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DW1151-D |
Protein A/G磁珠 |
1ml |
4℃,一年 |
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DW1151-E |
LiCl wash buffer |
25ml |
4℃,一年 |
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DW1151-F |
Elution buffer |
1ml |
4℃,一年 |
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DW1151-G |
5 M NaCl |
500ul |
4℃,一年 |
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DW1151-H |
Proteinase K |
100ul |
-20℃,一年 |
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DW1151-I |
RNase A |
100ul |
-20℃,一年 |
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DW1151-J |
0.1 MTT |
200ul |
-20℃,一年 |
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DW1151-K |
10 x Glycine solution |
50ml |
4℃,一年 |
自备产品:
甲醛溶液(推荐CST)、蛋白酶抑制剂、 磷酸酶抑制剂、 DNA纯化试剂盒
样品准备:
1. 细胞数量:
建议使用1-5×107个细胞进行ChlP实验。细胞数量过少可能导致DNA浓度不足,影响后续实验。
2. 甲醛交联:
(1)配制1%甲醛溶液:将20 ml无血清培养基与甲醛溶液摇匀,使甲醛的终浓度为1%。
(2)弃去细胞培养基, 用PBS洗涤细胞2次。
(3)加入18ml 1%甲醛溶液,室温孵育2-10分钟。注:交联时间根据实验需求和样本调整,通常
2-10分钟足够。交联时间过长可能导致DNA片段过大,影响后续超声处理。
3.终止交联:
(1)加入2 ml 10 x甘氨酸溶液, 摇匀,室温反应5分钟, 终止交联反应。
(2)弃去上清液,加入10 ml预冷的PBS,洗涤细胞2次,去除残留的甲醛和甘氨酸。
4.细胞收集:
(1)加入 10 ml 预冷的PBS, 用细胞刮将细胞刮下, 并转移至 15 ml 离心管中。
(2)1000 X g, 4度, 离心 5 分钟, 弃去上清液。
细胞裂解:
细胞加入1mL Cell lysis buffer( DW1151-A ),【注】使用前加入适量蛋白酶抑制剂和磷酸酶抑制剂,充分混匀,冰上反应10分钟。
超声处理:
1.使用超声仪将 DNA 打断成 200 -1000 bp的片段。 【注】超声条件需要根据细胞类型和超声仪型号进行优化。
2.推荐条件:使用 3mm 探头,设置跟大超声功率约 300W,每次超声 20 秒,休息 40秒, 重复 10-20 次。 注意:避免样品过热, 超声过程中不要产生气泡,建议用间接超声仪,在冰里面操作。
3.超声后, 8000 x g, 4度, 离心 10 分钟, 收集上清液, 即获得交联染色质制备物, 可置于-80 C保存。
4.取出 50 µL 已超声的样品检测 DNA 的浓度及片段大小。 【注】可根据 DNA 的片段大小调整超声时间。
检测 DNA 浓度及片段大小
1. 取出 50 µL 超声后的样品, 加入 4.8 µL 5 M NaCl (DW1151-G)和 2 µL RNase A(DW1151-I) ,65 C反应 2 小时。
2. 加入 2 ul Proteinase K (DW1151-H), 60度反应 1 小时。
3. 使用 DNA 纯化试剂盒或酚氯仿法纯化 DNA。
4. 将 DNA 稀释 50 倍,检测 0D260 值,计算DNA 浓度(µg/ml = OD260 x 2500)。 理想 DNA 浓度应在 50-200 µg/ml。
5. 使用 1%琼脂糖凝胶电泳分析 DNA 片段大小,确保 DNA片段在 200-1000 bp之间。
Chromatin IP
【注】Cell lysis buffer 在使用前已加入蛋白酶抑制剂和磷酸酶抑制剂。 1. 按照下表配制 Chromatin IP Mix:
1. 按照下表配制 Chromatin IP Mix:
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试剂名称 |
体积 (ul) |
终浓度 |
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Cell lysis buffer(DW1151-A ) |
0- 300 |
体积为495ul-交联染色质提交体积 |
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0.1 MTT(DW1151-J) |
5 |
1 µM |
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交联染色质制备物 |
200- 500 |
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合计 |
500ul |
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【注】应设置阴性对照和阳性对照。 同时取出 10 µL交联染色质制备物作为 Input。
2. 抗体孵育:
在 Chromatin lP Mix中加入 IP 级抗体, 混匀, 4°c旋转孵育 4 小时以上或过夜。【注】抗体使用通常为 2-5 µg,具体用量参考抗体生产商的推荐。
3. 磁珠处理:
(1)将 Protein A/G Magnetic Beads(DW1151-D) 重悬, 取 50 µL 至新的离心管中。
(2)将离心管置于磁力架上, 收集磁珠并弃掉上清液。
(3)加入 100 µL Cell lysis buffer(DW1151-A ), 重悬磁珠, 置于磁力架上, 收集磁珠并弃掉上清液。
重复洗涤—次。
4.免疫沉淀:
将 Chromati nlPMix加入含有磁珠的离心管中, 4°c旋转孵育 2 小时。
4. 洗涤步骤:
(1)将离心管置于磁力架上,收集磁珠并弃掉上清液。
(2)加入 1 ml Low Salt Wash Buffer(DW1151-B), 温和重悬磁珠, 4°c旋转孵育 5 分钟。
(3)重复洗涤 2-3 次。
(4)加入 1 ml High Salt Wash Buffer(DW1151-C),温和重悬磁珠, 4°c旋转孵育 5 分钟。
(5)加入 1 ml LiCI Wash Buffer(DW1151-E),溫和重悬磁珠,置于磁力架上,收集磁珠。
6. 洗脱:
(1)加入 100 µL Elution Buffer(DW1151-F), 涡旋, 65°C孵育 30 分钟。
(2)将离心管置于磁力架上,收集上清液至新的离心管中。
7. DNA 纯化:
(1)向每个反应(包括 Input)中加入 6 µL 5 M NaCl(DW1151-G) 和 2 µL Proteinase K(DW1151-H), 65°C反应 2 小时。
(2)使用 DNA 纯化试剂盒或酚氯仿法纯化 DNA.
注意事项:
1.本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。
2.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
本产品在文章中的写法:
英文: Dowobio (Shanghai,China)
中文: 上海多沃生物科技有限公司 Dowobio,上海
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