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产品名称:染色质免疫共沉淀(ChIP)试剂盒

英文名称:ChIP Assay Kit

产品货号:DW1151

产品包装:20T

产品价格:2000

保质期:1年

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产品介绍:

      染色质免疫共沉淀(ChIP)试剂盒,包含足够完成 20个反应的试剂。

试剂盒组分:

产品编号

产品名称

    包装

 保存温度

DW1151-A

Cell lysis buffer

25ml

4℃,一年

DW1151-B

Low salt wash buffer

80ml

4℃,一年

DW1151-C

High salt wash buffer

25ml

4℃,一年

DW1151-D

Protein A/G磁珠

1ml

4℃,一年

DW1151-E

LiCl wash buffer

25ml

4℃,一年

DW1151-F

Elution buffer

1ml

4℃,一年

DW1151-G

5 M NaCl

500ul

4℃,一年

DW1151-H

Proteinase K

100ul

-20℃,一年

DW1151-I

RNase  A

100ul

-20℃,一年

DW1151-J

0.1 MTT

200ul

-20℃,一年

DW1151-K

10 x Glycine solution

50ml

4℃,一年

 

自备产品:

甲醛溶液(推荐CST)、蛋白酶抑制剂、 磷酸酶抑制剂、 DNA纯化试剂盒

样品准备:

1. 细胞数量

建议使用1-5×107个细胞进行ChlP实验。细胞数量过少可能导致DNA浓度不足,影响后续实验。

2. 交联:

(1)配制1%甲醛溶液:将20 ml无血清培养基与甲醛溶液摇匀,使甲醛的终浓度为1%。

(2)弃去细胞培养基, 用PBS洗涤细胞2次。

(3)加入18ml  1%甲醛溶液,室温孵育2-10分钟。注:交联时间根据实验需求和样本调整,通常

2-10分钟足够。交联时间过长可能导致DNA片段过大,影响后续超声处理。

3.终止交联:

(1)加入2 ml 10 x甘氨酸溶液, 摇匀,室温反应5分钟, 终止交联反应。

(2)弃去上清液,加入10 ml预冷的PBS,洗涤细胞2次,去除残留的甲醛和甘氨酸。

4.细胞收集:

(1)加入 10 ml 预冷的PBS, 用细胞刮将细胞刮下, 并转移至 15 ml 离心管中。

(2)1000 X g, 4度, 离心 5 分钟, 弃去上清液。

细胞裂解:

细胞加入1mL   Cell lysis buffer( DW1151-A ),【注】使用前加入适量蛋白酶抑制剂和磷酸酶抑制剂,充分混匀,冰上反应10分钟。

超声处理:

1.使用超声仪将 DNA 打断成 200 -1000 bp的片段。 【注】超声条件需要根据细胞类型和超声仪型号进行优化。

2.推荐条件:使用 3mm 探头,设置跟大超声功率约 300W,每次超声 20 秒,休息 40秒, 重复 10-20 次。 注意:避免样品过热, 超声过程中不要产生气泡,建议用间接超声仪,在冰里面操作。

3.超声后, 8000 x g, 4度, 离心 10 分钟, 收集上清液, 即获得交联染色质制备物, 可置于-80 C保存。

4.取出 50 µL 已超声的样品检测 DNA 的浓度及片段大小。 【注】可根据 DNA 的片段大小调整超声时间。

 

检测 DNA 浓度及片段大小

1. 取出 50 µL 超声后的样品, 加入 4.8 µL 5 M NaCl (DW1151-G)和 2 µL RNase  A(DW1151-I)  ,65 C反应 2 小时。

2. 加入 2 ul Proteinase K (DW1151-H), 60度反应 1 小时。

3. 使用 DNA 纯化试剂盒或酚氯仿法纯化 DNA。

4. 将 DNA 稀释 50 倍,检测 0D260 值,计算DNA 浓度(µg/ml = OD260 x 2500)。 理想 DNA 浓度应在 50-200 µg/ml。

5. 使用 1%琼脂糖凝胶电泳分析 DNA 片段大小,确保 DNA片段在 200-1000 bp之间。

 

Chromatin IP

【注】Cell lysis buffer 在使用前已加入蛋白酶抑制剂和磷酸酶抑制剂。 1. 按照下表配制 Chromatin IP Mix:

1. 按照下表配制 Chromatin IP Mix:

试剂名称

体积 (ul)

终浓度

Cell lysis buffer(DW1151-A )

0- 300

体积为495ul-交联染色质提交体积

0.1 MTT(DW1151-J)

5

1 µM

交联染色质制备物

200- 500

 

合计

500ul

 

【注】应设置阴性对照和阳性对照。 同时取出 10 µL交联染色质制备物作为 Input。

 

2. 抗体孵育:

在 Chromatin lP Mix中加入 IP 级抗体, 混匀, 4°c旋转孵育 4 小时以上或过夜。【注】抗体使用通常为 2-5 µg,具体用量参考抗体生产商的推荐。

3. 磁珠处理:

(1)将 Protein A/G Magnetic Beads(DW1151-D) 重悬, 取 50 µL 至新的离心管中。

(2)将离心管置于磁力架上, 收集磁珠并弃掉上清液。

(3)加入 100 µL Cell lysis buffer(DW1151-A ), 重悬磁珠, 置于磁力架上, 收集磁珠并弃掉上清液。

重复洗涤—次。

4.免疫沉淀:

将 Chromati nlPMix加入含有磁珠的离心管中, 4°c旋转孵育 2 小时。

 

4. 洗涤步骤:

(1)将离心管置于磁力架上,收集磁珠并弃掉上清液。

(2)加入 1 ml Low Salt Wash Buffer(DW1151-B), 温和重悬磁珠, 4°c旋转孵育 5 分钟。

(3)重复洗涤 2-3 次。

(4)加入 1 ml High Salt Wash Buffer(DW1151-C),温和重悬磁珠, 4°c旋转孵育 5 分钟。

(5)加入 1 ml LiCI Wash Buffer(DW1151-E),溫和重悬磁珠,置于磁力架上,收集磁珠。

 

6. 洗脱:

(1)加入 100 µL Elution Buffer(DW1151-F), 涡旋, 65°C孵育 30 分钟。

(2)将离心管置于磁力架上,收集上清液至新的离心管中。

 

 

7. DNA 纯化:

(1)向每个反应(包括 Input)中加入 6 µL    5 M NaCl(DW1151-G) 和 2 µL Proteinase K(DW1151-H), 65°C反应 2 小时。

(2)使用 DNA 纯化试剂盒或酚氯仿法纯化 DNA.

 

注意事项:

1.本产品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅内。

2.为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

 

本产品在文章中的写法:

 

英文: Dowobio (Shanghai,China)

 

中文: 上海多沃生物科技有限公司  Dowobio,上海

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